У 2023 році для макcимально ефективного вирішення завдань, що стоять перед Інститутом було проведено зміну його структури. Сьогодні Інститут має 2 відділення, 8 наукових відділів, дослідну мережу з 1 дослідної станції та 2 дослідних господарств, які знаходяться у різних кліматичних зонах України.
